ایشان مرجع تقلید شیعه ساکن نجف و پدر سید محمد حسینی شاهرودی که از شاگردان میرزای نائینی و آقاضیاء عراقی بود و پس از سید ابوالحسن اصفهانی به مرجعیت رسید. احداث مسجد، حسینیه و مدرسه علمیه در کابل و برخی شهرهای ایران از جمله اقدامات وی است. او در 16 شعبان سال 1395ق در ۹۴ سالگی درگذشت و در حرم امام علی(ع) دفن شد.