​​​​​​​احمد توکلی با ارسال نامه‌ای به رئیس مجلس از این موضوع انتقاد کرد و نداشتن تحصیلات کافی و سابقه مناسب در کارنامه بذرپاش را علت مخالفتش با انتصاب وی به عنوان رئیس دیوان محاسبات دانست. وی در نامه‌اش به قالیباف نوشته بود: «پذیرش داوطلبی آقای بذرپاش از اساس غیرقانونی است. چرا که تبصره یک ماده ۵۱ قانون آیین‌نامه داخلی مجلس می‌گوید داوطلب باید حداقل 20 سال سابقه کار داشته باشد؛ در حالی که سابقه کار نامبرده به ۱۷ سال هم نمی‌رسد». او انتصاب بذرپاش را بدعت و غیر قانونی توصیف کرد و در همان نامه‌ای که اشاره شد، تأکید کرد سابقه حضور وی در بسیج دانشجویی به عنوان سابقه کاری در نظر گرفته شده است. موضوعی که واکنش بسیج دانشجویی دانشگاه شریف را نیز برانگیخت و بسیجیان آن دانشگاه خواستار پاسخ‌گویی بذرپاش شدند. البته بذرپاش در واکنش به این مسائل در توییتی نوشت: «بنده از سال ۷۹ تا نیمه ۸۲ در مراکز تحقیقاتی و پژوهشی دانشگاه صنعتی شریف مشغول به کار بوده و افتخار همکاری با شهید مصطفی احمدی ‌روشن را داشتم». همزمان نامه‌ای هم از پژوهشکده سامانه‌های هوشمند صنعتی شهید رضایی منتشر شد که در آن انتصاب بذرپاش به عنوان معاون آموزشی این پژوهشگاه را در سال‌های 79 تا 82 تأیید می‌کرد. با این حال انتشار این نامه به‌اصطلاح به قوز بالای قوز تبدیل شد؛ آنجایی که برخی اخبار مبنی بر اینکه این مؤسسه سال 1392 ثبت و تأسیس شده، انتشار یافت. با همه این مسائل اما بذرپاش به ریاست دیوان محاسبات کشور رسید و کم‌کم ماجراهای مربوط به وی از تیتر اخبار رسانه‌ها خارج شد. با این حال این روزها که از وی به عنوان گزینه اصلی دولت برای تصدی وزارت راه و شهرسازی یاد می‌شود، دوباره همه این موضوعات بر سر زبان‌ها افتاده است؛ آنجایی که علی بهادری جهرمی، سخنگوی دولت در توییتی از تصمیم دولت برای انتصاب مهرداد بذرپاش به ‌عنوان وزیر پیشنهادی راه و شهرسازی خبر داد.  از قول سید نظام‌الدین موسوی آمده: «بذرپاش مدیری توانمند، با برنامه و مسئولیت‌پذیر است. یکی از شعارهای دولت سیزدهم ساخت مسکن در راستای حل مشکلات مردم بود. این هدف توسط وزیری جوان و توانمند مانند بذرپاش قابل تحقق خواهد بود». با این حال در کنار این حمایت‌ها انتخاب بذرپاش به عنوان گزینه وزارتی انتقاداتی هم بین نمایندگان مجلس داشته است. مجتبی توانگر، دیگر نماینده مجلس در توییتی نوشت: «هر وزارتخانه‌ای که احتمال تغییر آن می‌رود، این آقای همه‌جا گزینه از طریق یکی از معاونان به رئیس‌جمهور برای تصاحب آن کرسی فشار می‌آورد». باید دید آیا بذرپاش می‌تواند به عنوان متصدی این وزارتخانه سکان آن را به دست گیرد و مجلسیان به وی اعتماد خواهند کرد یا خیر؟ وزارتخانه‌ای که بخش بزرگی از وعده‌های دولت یعنی ساخت 4 میلیون مسکن را نیز عهده‌دار است.