از زمان استقرار دوباره حاکمیت طالبان در افغانستان، جامعه تشیع این کشور تلاش زیادی کرده تا با در پیش گرفتن رویکرد مداراجویانه و مبتنی بر تبعیت از حاکمیت نو، مانع دامن زدن به اختلافات سیاسی و مذهبی شوند. با این حال، حوادث چند هفته اخیر که شامل کشتن چند عالم دینی شیعه در شهر هرات می‌شود، تردیدها را در روابط امارت اسلامی طالبان و شیعیان به‌وجود آورده است. هر چند در وهله نخست، این دیدگاه که ترورهای اخیر با هدف برهم زدن روابط طرفین انجام می‌گیرد تا حدی منطقی به نظر می‌رسد؛ اما نباید این مهم را نیز نادیده گرفت که عملکرد حاکمیت طالبان ازجمله حذف علمای شیعه از ساختار شوراهای ولایتی علما و همچنین دیدگاه‌های اعلام شده از سوی برخی مقامات آن، در راستای تضعیف مدارای مذهبی عمل کرده است.  علاوه بر این، انتشار عقاید افراطی برخی مقامات رده بالای طالبان نیز در این مدت جنجال‌برانگیز بوده است. کتاب «مباحث فی العقیده الماتردیّه» به قلم «نوراحمد اسلام جار» والی کنونی هرات نمونه‌ای از این موارد است که در آن نسبت‌های ناروا و تحریک‌آمیز به شیعیان زده شده است. هر چند برخی با این استدلال که این کتاب‌ها پیش از حاکمیت طالبان نگاشته شده، سعی می‌کنند بر این‌گونه افراط گری‌ها سرپوش بگذارند، اما قرار گرفتن این افراد در مناصب عالی حکومتی از یک سو و تجدید چاپ چند باره این کتاب‌ها، جای هیچ‌گونه توجیهی باقی نمی‌گذارد. تردیدی نیست این وظیفه حاکمیت طالبان است که مانع شعله‌ور شدن تنش‌های مذهبی و بسترسازی رشد تفکرات و تحرکات تکفیری شود.