مرکز پژوهش‌های مجلس درباره عملکرد پژوهشگاه میراث فرهنگی از انحراف بالای بازوی پژوهشی وزارت میراث فرهنگی، نسبت به اهداف تأسیس و اسناد بالادستی به‌ویژه در حوزه باستان‌شناسی خبر داد. به گزارش قدس، «نتایج نشان می‌دهد حدود ۲۷ درصد اهداف تعریف شده در اساسنامه محقق نشده و نزدیک به ۱۳ درصد دیگر از اهداف به‌طور مشروط محقق شده است».